Что делать если в купленной квартире было зарегистрировано ООО?!

А как вы оформили квартиру на себя? Идите в то БТИ с документами ,где вы зарегистрировали квартиру на себя, в налоговую. Если нужно ,то и в прокуратура. Чем быстрее, тем лучше для вас.

Если учредителем ООО является одно физическое лицо - то оно действительно имеет право указать при регистрации адрес своей квартиры как юридический адрес. Никаких особых последствий для Вас это не влечет, кроме прихода чужой корреспонденции на Ваш адрес и возможных звонков из налоговой (поскольку скорее всего и телефон квартиры тоже указан при регистрации, как телефон ООО. Вы имеете полное право потребовать от продавца перерегистрации ООО на другой адрес. Кроме того, после приобретения квартиры Вы можете и сами обратиться в налоговую с заявлением, что данное ООО больше не относится к этому адресу и налоговая уже сама будет разбираться с учредителем и директором ООО.

Очень сложно перерегистрировать ооо на другой адрес. Вам это ничем не грозит, кроме сказанного выше

Вы не в поисковике смотрите, а в системах типа СБИСа, там актуальная информация о юр адресе и статусе (действующее, или ликвидированно), можете мне написать название юрлица и ИНН, я гляну юрадрес и статус в СБИС Компаниях , у нас на работе он подключен))). Возможно они уже давно перерегистрировали юрадрес, а это просто старая инфа в инете.

В налоговую с заявлением и копией договора купли-продажи. Всё, никаких негативных последствий для вас нет.